Classification des algues

Voici un essai de synthèse tenant compte des données classiques et des séquences génétiques. Bruno de Reviers distingue onze grands ensembles d'algues ("Biologie et phylogénie des algues". Belin Sup. , 2003)

1. Super règne. Prokaryota = Procaryotes.
Règne. Eubacteria = Eubactéries = Vraies bactéries.
Sous règne. Glycobacteria = Glycobactéries.
Division, phylum, embranchement. Cyanophyta = Cyanophytes.
Classe. Cyanophyteae = Cyanophycées.
Ordres.
Chroococcales. Ex: Choococcus.
Pleurocapsales. Ex: Pleurocapsa. Oscilatoriales. Ex: Oscillatoria.
Nostocales. Ex: Nostoc.
Stignomatales. Ex: Stignoma. Rivularia.

2. Super règne. Eukaryota = Eucaryotes.
2.1. Règne. Plantae = Primoplastobiota = Plantes vertes.
2.1.1. Sous règne. Glaucobionta = Glaucobiontes.
Division, phylum, embranchement. Glaucophyta = Glaucophytes.
Classe. Glaucophyceae = Glaucophycées. Algues unicellulaires lacustres à 2 flagelles; plastes colorés en bleu, chlorophylle a + phycobiliprotéines (phycocyanine, allophycocyanine) dans phycobilisomes + caroténoïdes (carotène + zeaxanthine + cryptoxanthine), thylacoïdes non groupés. 2 flagelles apicaux.
Ordres.
Cyanophorales. Ex: Cyanophora.
Gloeochaetales. Ex: Gloeochaete
Glaucocystales. Ex: Glaucocystis.

2.1.2. Sous règne. Rhodobionta = Rhodobiontes.
Division, phylum, embranchement. Rhodophyta = Rhodophytes = Algues rouges. Cellules sans flaghelles, Grain d'amidon floridéen dans le cytoplasme, présence de synapses intercellulaires.
Classe. Cyanidiophyceae = Cyanidiophycées. Algues unicellulaires. Ex: Cyanidium

Classe. Bangiophycae = Bangiophycées ;
(Groupe paraphylétique).
Ordres.
Porphyridiales. Ex: Porphyra.
Rhodochaetales. Ex: Rhodochaete.
Erytropeltidales. Ex: Erytrocladia.
Compsopogonales. Ex: Compsopogon.
Bangiales. Ex: Bangia.

Classe. Floridéophyceae = Floridéophycées .
Chlorophylles a, d + phycobiliprotéines (phycocyanine, phycoérythrine, allophycocyanine) dans phycobilisomes + caroténoïdes (carotènes + xanthophylles, zeaxanthine et lutéine). Thylacoïdes non groupés. Plastes à 2 membranes.
Ordres.
Lignée1.
Hildenbrandiales. Ex: Hildenbrandia
Lignée 3.
Ahnelfeltiales. Ex: Ahnelfeltia
Lignée 4.
Gracilariales. Ex: Gracilaria.
Rhodymeniales. Ex: Rhodymenia.
Ceramiales. Ex: Ceramium,
Plocamiales. Ex: Plocamium.
Halymeniales = Cryptonemiales. Ex: Halimenia. .
Gelidiales. Gelidium,
Bonnemaisoniales. Ex: Asparagopsis.
Gigartinales (paraphylétique). Ex: Gigartina, Pterocladia, Hypnea.
Lignée 2.
Corallinales. Ex: Amphiroa, Corallina.
Rhodogorgonales. Ex: Rhodogorgona.
Balliales. Ex: Ballia.
Thoreales. Ex: Thorea.
Batrachospermales. Balbianales.
Acrochaetiales. Ex: Rhodochorton, Achrochaetium.
Palmariales. Ex: Palmaria.
Nemaniales. Ex: Nemalion.
Colaconematales. Ex: Colaconema.

2.1.3. Sous règne. Chlorobionta = Chlorobiontes. "Organismes verts".
Pigments: Chlorophlles a, b.

2.1.3.1. Infra règne. Chlorophyta = Chlorophytes. Algues vertes marines, algues d'eau douce, algues aériennes, thylacoïdes groupés parfois dans des grana, chloroplastes à 2 membranes, présence de flagelles.
Classe. Prasinophyceae = Prasinophycées (Micromonadophytes).  Groupe paraphylétique. Algues unicellulaires. flagellées couvertes d'écailles organiques.
Ordres.
Mamiellales. Ex: Micromonas.
Pyramimonadales. Ex: Pyramimonas.
Pseudoscourfieldiales. Ex: Nephroselmis.
Chlorodendrales. Ex: Tetraselmis.

Classe. Pedinophyceae = Pédinophycées. Algues unicellulaires aquatiques à corps nu à un seul flagelle.
Ordre. Pedinomonadales. Ex: Pedinomonas.
Ordre. Chlorodendrales

Classe. Ulvophyceae. Groupe paraphylétique.
Ordres.
Trentepohliales. Ex: Trentepohlia.
Ulothricales. Ex: Ulothrix.
Ulvales. Ex: Ulva.
Cladophorales. Ex: Cladophora, Chaetomorpha, Valonia.
Bryopsidales. Ex: Bryopsis, Codium. Halimedales. Ex: Halimeda, Caulerpa.
Dasycladales. Ex: Acetabularia, Dasicladus,

Classe. Chlorophyceae = Chlorophycées sensu stricto. Algues unicellulaires ou coloniales, immobiles ou nageant à l'aide de un ou plusieurs flagelles.
Ordres.
Dunaliellales. Ex: Dunaliella.
Chlamydomonadales. Ex: Chlamydomonas.
Volvocales. Ex: Volvox.
Tetrasporales. Ex: Tetraspora.
Chlorococcales. Chlorococcum.
Chlorosarcinales. Ex: Chlorasarcina.
Sphaeroplaeales. EX: Scenedesmus.
Microsporales. Ex: Microspora.
Oedogoniales. Ex: Oedogonium.
Cylindrocapsales. Ex: Cylindrocapsa.
Chaetophorales. Ex: Chaetophora, Draparnaldia.
Chaetopeltidales. Ex: Chetopeltis.

Classe.Trebouxiophyceae = Trebouxiophycées. Algues unicellulaires, filamenteuses ou foliacées de petite taille, marines, d'eau douce ou aériennes.
Ordres.Trebouxiales. Ex: Trebouxia, Chlorella.Microthamniales. Ex: Microthamnium.

2.2. Position incertaine.
Ordre des Prasiolales. Algues unicellulaires filamenteuses ou foliacées de petite taille, marines, d'eau douce ou aériennes.
Ordre. Prasiolales. Ex: Prasiola.
Infra règne des Streptophyta = Streptophytes (Algues + Embryophytes).
Division = Phylum = embranchement. Streptophycophytes.

Classe. Mesostigmatophyceae. Flagellés d'eau douce (flagelles unilatéraux). Ex: Mesostigma.

Classe  Zygnematophyceae = Zygnematophycées. Algues vertes unicellulaires ou filamenteuses dépourvues de flagelles, d'eaux douces ou saumâtres; elles vivent aussi dans la neige et la glace.
Ordre. Zygnematales. Ex: Micrasterias, Spirogyra, Zygnema.

Classe. Klorokybophyceae + Klorokybophycées. Algues subaériennes formées de cellules dans un mucilage.
Ordre. Klorokybophytales. Ex: Chlorokybus.

Classe. Klebsormidiophyceae = Klebsormidiophycées. Vivent en épiphytes dans les lacs d'eau duce; forment des files de cellules en forme de coussinets arrondis de quelques mm; appendices en forme de poils. Ex: Klebsormidium.

Classe Coleochaetophyceae = Coleochaetophycées.
Ordre. Coleochaetophytales. Ex: Coleochaete.
Classe Charophyceae = Charophycées.
Ordre. Charales. Ex: Chara.

2.3. Position incertaine.
2.3.1. Sous règne Cryptista.
Division, phylum, embranchement. Cryptophyta (= Cryptomonadida) = Cryptophytes.
Classe. Cryptophyceae = Cryptophycées. Algues unicellulaires photosynthétiques  à 2 flagelles antérieurs, chlorophylles a, c, phycoérythrine ou phycocyanine. Ex: Cryptomonas, Chilomonas.

2.3.2. Sous règne. Discicristata.
Division, phylum, embranchement. Euglenozoa = euglènobiontes = Euglènophytes. Algues unicellulaires d'eaux marines,douces et saumâtres, chlorophylles a, b, thylacoïdes groupés par 3, 2 flagelles antérieurs.
Classe. Euglenophyceae = Euglenophytes. Ex: Euglen.

2.3.3. Sous règne Sarcomastigota.
Division, phylum, embranchement. Cercozoa.
Sous phylum. Chlorarachniophyta = Reticulofilosa.
Classe. Chlorarachniophyceae = Chlorarachniophycées. Ex: Cryptoclora, Chlorarachnion.

2.3.4. Sous règne. Haptobionta.
Division, Phylum, embranchement. Haptophyta = Haptophytes. Chlorophylles a, c, thylacoïdes par 3.
Classe. Pavlovophyceae = Pavlovophycées. Algues unicellulaires planctoniques marines à 2 flagelles inégaux et à appendice filiforme (haptonème). Ex: Pavlova.

Classe. Prymnesiophyceae ou haptophyseae = Haptophycées = Coccolithophoridées. Flagellés unicellulaires planctoniques marins à plaste brun doré possédant un haptonène et 2 flagelles lisses et de même taille; corps couvert d'écailles organiques ou calcaires. Ex: Primnesium, Coccolithus.

2.3.5. Sous règne. Heterokonta = Stramenopiles.
Division, phylum, embranchement Ochrophyta = Ochrophytes (Algues "brun doré"). chlorophylles a, c, thylacoïdes par 3 dans des lamelles, 2 flagelles, 1 lisse, 1 porteurs de mastigonèmes.
Classe. Pinguiophyceae.

Classe. Bacillariophceae = Diatomophyceae. Bacillariophycées ou Diatomées. Algues unicellulaires recouvertes d'un frustule siliceux bivalve; vivent dans tous les milieux aquatiques. Ex: Navicule.

Classe. Bolidophyceae = Bolidophycées. Flagellés planctoniques marins autotrophes. Ex: Bolidomonas.

Classe. Parmophyceae = Parmophycées. Algues unicellulaires nanoplanctoniques marines couvertes de 5  à 8 plaques siliceuses. Ex: Pentalamina.

Classe. Pelagophyceae = Pelagophycées. Algues planctoniques ou benthiques unicellulaires ou coloniales, marines ou d'eaux saumâtres. EX: Pelegococcus, Nematochrysopsis.
Classe. Pedinellophyceae = Pedinelophycées = Silico-flagellés. Algues unicellulaires à expsquelette siliceux. Ex: Dictyocha.

Classe. Raphidophyceae = Raphidophycées. Algues unicellulaires marines ou d'eaux douces possédant des organes éjectiles (trichocystes); prolifèrent parfois en été. Ex: Heterosigma.

Classe. Phaeothamniophyceae = Phaeothamniophycées. Algues d'eaux douces ou saumâtres. Ex: Phaeothamnion.

Classe. Chrysomerophyceae = Chrysomerophycées. Algues marines benthiques. Ex: Chrysomeris.

Classe. Xanthophyceae = Xanthophycées ou "Algues jaunes". Pas de chlorophylle c, xanthophyle. Ex: vaucheria, Ophiocytium.

Classe. Schizocladiophyceae = Schizocladophycées.

Classe. Phaeophyceae = Phéophycées = Fucophycées ou "algues brunes". Présence de chlorophylles a, c, fucoxanthine, xanthophylles et de plasmodesmes.
Reviers et Rousseau (1999) distinguent les ordres suivants:
Ordre. Ascoseirales. Ex: Rissoella.
Ordre. Cutleriales. Ex: Cutleria.
Ordre. Desmarestiales. Ex: Desmaresia.
Ordre. Dictyotales. Ex: Dictyota, Dictyopteris, Dilophus, Padina, Taonia.
Ordre. Ectocarpales (Chordariales + Dictyosiphonales + Punctariales + scytosiphonales). Ex: Ectocarpus, Chorda, Dictyosiphon, Punctaria, Scytosiphon, Nemoderma, Colpomenia.
Ordre. Fucales. Ex: Fucus, Ascophyllum, Pelvetia, Sargassum.
Ordre. Laminariales. Ex: Laminaria.
Ordre. Ralfsiales. Ex: Ralfsia.
Ordre. Scytothamnales.
Ordre. Sphacelariales. Ex: Cladostephus, Stypocaulon.
Ordre. Sporochnales. Ex: Nereia
Ordre. Syringodermatales.
Ordre. Tilopteridiales.

Classe. Eustigmatophyceae = Eustigmatophycées. Pas de chlorophylle c, zoospores à 1 ou 2 flagelles. Ex: Eustigmatos..

Classe. Chrysophyceae = Chrysophycées ou "Algues dorées". Algues unicellulaires ou filamenteuses surtout dans les eaux douces; pigments = fucoxanthine, violaxanthine; forment des kystes (reposet résistance); zoospores flagellées à mastigonèmes. Ex: Ochromonas.

2.3.6. sous règne. Alveolata = Alveobiontes. Présence de vésicules sous membranaires (= réserves calciques).
Dinophyta = Dinoflagellata = Dinoflagellés = Yrrhophytes = Péridiniens. Clorophylles a,c, thylacoïdes par 3, 2 flagelles disposés perpendiculairement.
Classe. Dinophyceae. Dinophycées. Unicellulaires photosynthétiques ou non, biflagellés planctoniques, certains toxiques (responsables des "marées rouges" en mer).
Ordre. Gonyaulacales. Ex: Goniaulax.
Ordre. Péridiniales. Ex: Gymnodium, Dinophysis.
Classe. Blastodiniphyceae = Blastodiniphycées.
Ordre. Blastodiniales. Ex: Blastodinium.

Classe. Noctiluciphyceae = Noctiluciphycées. Ex: Noctiluca.

Classe. Syndiniophyceae = Syndiniophycées.
Ordre. Sydiniales.

Conclusions

1. Le règne des Plantae comprend les algues et les embryophytes caractérisés par la présence d'un archégone et d'un embryon. Les Fungi ou Champignons sont exclus du règne végétal.

2. Les algues ne constituent pas un groupe ou unité systématique (taxon) mais un ensemble hétérogène ; en effet plusieurs groupes n'ont pas d'ancêtre commun direct (groupes polyphylétiques appartenantappartenant à des lignées évolutives différentes (Cryptophyta, Euglenophyceae, Chlorachniophyceae, Haptophyta, Ochrophyta, Dinophyta) alors que d'autres contiennent l'ancêtre commun et la totalité des descendants (Groupes monoophylétiques ou clade : Florideophyceae, Chlorobionta...).